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快速,简便分析完好的拟南芥突变体种子的基因歧视性

基于 DART-MS 方法结合代谢组学
快速,简便分析完好的拟南芥突变体种子的基因歧视性


为获得有用的突变体需要高通量的筛选手段,这是植物功能基因组学研究和其应用的先决条件。在大气压环境下,DART-MS是一种有效的快速电离筛选工具。本研究采用DART-MS方法结合代谢组学快速,简便分析完好的拟南芥突变体种子的基因歧视性,在分析过程中无需任何前处理。采用最小二乘法分析实验数据,14个不同的种子来自于两个不同的生态背景:哥伦比亚(COL-0)和兰茨贝格万寿菊(LER)生态背景。实验结果表明,采用DART-MS分析的代谢谱可以区分完整的拟南芥种子的生态型和代谢途径。此外,潜在的新的代谢标志物可以被DART-MS检测和用于澄清的拟南芥品种之间的遗传关系。这种技术可以用于预测代谢突变体基因的功能无论形态表型。

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http://www.plantmethods.com/content/7/1/14